Trang web do chính Garrett Gyssler ra mắt vào tháng 4 năm 2006 và được duy trì cho đến năm 2008.[1]

Vào ngày 4 tháng 8 năm 2008, CraveOnline, một trang web giải trí và lối sống của nam giới thuộc sở hữu của AtomicOnline, đã mua MyAnimeList với số tiền không được tiết lộ.[5] Vào năm 2015, DeNA thông báo rằng họ đã mua MyAnimeList từ tay CraveOnline, và họ sẽ hợp tác với Anime Consortium Japan để phát trực tuyến anime trên dịch vụ, thông qua Daisuki.[2][6]

MyAnimeList đã thông báo vào tháng 4 năm 2016 rằng họ đã nhúng các tập phim từ Crunchyroll và Hulu trực tiếp lên trang web, với hơn 20.000 tập được cung cấp trên trang web.[7]

Vào tháng 4 năm 2017, MyAnimeList đã bổ sung thêm The King's Avatar, phim hoạt hình Trung Quốc đầu tiên vào cơ sở dữ liệu của trang web.[8]

Vào ngày 8 tháng 3 năm 2018, MyAnimeList đã mở một cửa hàng manga trực tuyến, hợp tác với Kodansha Comics và Viz Media, cho phép người dùng mua manga kỹ thuật số từ trang web. Dịch vụ ban đầu được ra mắt tại Canada nhưng sau đó mở rộng sang Mỹ, Anh và một số quốc gia nói tiếng Anh khác.[9]

MAL không thể truy cập được trong vài ngày vào tháng 5 và tháng 6 năm 2018 khi nhân viên trang web ngưng kết nối để bảo trì, với lý do lo ngại về bảo mật và quyền riêng tư.[1][10] Các nhà điều hành trang web cũng đã tắt API cho các ứng dụng của bên thứ ba, khiến chúng không thể sử dụng được.[1] Các động thái này được thực hiện trong nỗ lực tuân thủ chương trình GDPR của Liên minh Châu Âu.[1][10]